Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PLOD1Q02809 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms