Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
NHLH2Q02577 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
NHLH2Q02577 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms