Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CYP27A1Q02318 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.5 ms