Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 AL589935.2-201ENST00000616471 1231 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MDM2Q00987 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC19■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
MDM2Q00987 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms