Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
HSF1Q00613 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms