Protein–RNA interactions for Protein: P61247

RPS3A, 40S ribosomal protein S3a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP61247 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RPS3AP61247 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPS3AP61247 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms