Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ERVFRD-1P60508 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms