Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
UBASH3AP57075 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UBASH3AP57075 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms