Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NRG3P56975 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms