Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CDH15P55291 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms