Protein–RNA interactions for Protein: P51449

RORC, Nuclear receptor ROR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RORCP51449 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
RORCP51449 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.65□□□□□ -0.07
RORCP51449 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
RORCP51449 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
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RORCP51449 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RORCP51449 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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RORCP51449 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
RORCP51449 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RORCP51449 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RORCP51449 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
RORCP51449 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
RORCP51449 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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