Protein–RNA interactions for Protein: P49450

CENPA, Histone H3-like centromeric protein A, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPAP49450 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CENPAP49450 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPAP49450 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPAP49450 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPAP49450 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPAP49450 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPAP49450 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPAP49450 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPAP49450 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CENPAP49450 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CENPAP49450 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.05■□□□□ 0
CENPAP49450 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CENPAP49450 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CENPAP49450 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms