Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561P49447 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561P49447 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561P49447 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561P49447 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561P49447 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561P49447 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CYB561P49447 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYB561P49447 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CYB561P49447 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYB561P49447 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYB561P49447 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYB561P49447 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYB561P49447 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CYB561P49447 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CYB561P49447 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CYB561P49447 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CYB561P49447 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms