Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCCP43146 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 AC104306.2-201ENST00000451877 341 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCCP43146 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCCP43146 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCCP43146 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCCP43146 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCCP43146 HEBP1-201ENST00000014930 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCCP43146 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCCP43146 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCCP43146 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCCP43146 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCCP43146 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCCP43146 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCCP43146 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCCP43146 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCCP43146 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCCP43146 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCCP43146 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DCCP43146 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
DCCP43146 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCCP43146 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCCP43146 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCCP43146 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCCP43146 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCCP43146 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCCP43146 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCCP43146 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCCP43146 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms