Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
GGCXP38435 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
GGCXP38435 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
GGCXP38435 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms