Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PPARGP37231 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms