Protein–RNA interactions for Protein: P35354

PTGS2, Prostaglandin G/H synthase 2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS2P35354 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PTGS2P35354 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms