Protein–RNA interactions for Protein: P35222

CTNNB1, Catenin beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNB1P35222 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CTNNB1P35222 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms