Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PTGER1P34995 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms