Protein–RNA interactions for Protein: P22676

CALB2, Calretinin, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALB2P22676 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CALB2P22676 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CALB2P22676 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALB2P22676 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALB2P22676 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALB2P22676 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALB2P22676 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALB2P22676 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALB2P22676 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALB2P22676 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALB2P22676 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALB2P22676 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALB2P22676 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALB2P22676 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CALB2P22676 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CALB2P22676 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms