Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PRR34-201ENST00000396008 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 C7orf57-203ENST00000430738 2056 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 AC232323.1-201ENST00000540724 2099 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
HOXA5P20719 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms