Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CTLA4P16410 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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