Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
E2F3O00716 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
E2F3O00716 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms