Protein–RNA interactions for Protein: E9PIF3

NPIPA2, Nuclear pore complex-interacting protein family member A2, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA2E9PIF3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
NPIPA2E9PIF3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NPIPA2E9PIF3 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms