Protein–RNA interactions for Protein: A6NGW2

STRCP1, Putative stereocilin-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCP1A6NGW2 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
STRCP1A6NGW2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
STRCP1A6NGW2 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms