Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SH3BP1Q9Y3L3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms