Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ERVW-1Q9UQF0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms