Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
APEX2Q9UBZ4 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
APEX2Q9UBZ4 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms