Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVW2

RLIM, E3 ubiquitin-protein ligase RLIM, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLIMQ9NVW2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RLIMQ9NVW2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms