Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSU2

TREX1, Three-prime repair exonuclease 1, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1Q9NSU2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
TREX1Q9NSU2 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TREX1Q9NSU2 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms