Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CLSPNQ9HAW4 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms