Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV87

CNPPD1, Protein CNPPD1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPPD1Q9BV87 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CNPPD1Q9BV87 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CNPPD1Q9BV87 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms