Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
C9orf16Q9BUW7 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms