Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUP0

EFHD1, EF-hand domain-containing protein D1, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD1Q9BUP0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
EFHD1Q9BUP0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
EFHD1Q9BUP0 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms