Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TMEM79Q9BSE2 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms