Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQW3

EBF4, Transcription factor COE4, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBF4Q9BQW3 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
EBF4Q9BQW3 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
EBF4Q9BQW3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms