Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQP9

BPIFA3, BPI fold-containing family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPIFA3Q9BQP9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
BPIFA3Q9BQP9 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
BPIFA3Q9BQP9 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms