Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ECSITQ9BQ95 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms