Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GTF3C6Q969F1 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
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GTF3C6Q969F1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
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GTF3C6Q969F1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
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GTF3C6Q969F1 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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GTF3C6Q969F1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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GTF3C6Q969F1 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GTF3C6Q969F1 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
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