Protein–RNA interactions for Protein: Q8NG08

HELB, DNA helicase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELBQ8NG08 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
HELBQ8NG08 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
HELBQ8NG08 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms