Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 EMC4-203ENST00000557879 1009 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
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ZNF248Q8NDW4 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ZNF248Q8NDW4 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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