Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z353

HDX, Highly divergent homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDXQ7Z353 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HDXQ7Z353 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms