Protein–RNA interactions for Protein: Q76M96

CCDC80, Coiled-coil domain-containing protein 80, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC80Q76M96 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 AL009178.2-201ENST00000597278 2719 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CCDC80Q76M96 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms