Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SMARCD3Q6STE5 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SMARCD3Q6STE5 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms