Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ANKRD54Q6NXT1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms