Protein–RNA interactions for Protein: Q5JSH3

WDR44, WD repeat-containing protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR44Q5JSH3 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
WDR44Q5JSH3 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms