Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
KLHL12Q53G59 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms