Protein–RNA interactions for Protein: Q495N2

SLC36A3, Proton-coupled amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC36A3Q495N2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SLC36A3Q495N2 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms