Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SP6Q3SY56 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SP6Q3SY56 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SP6Q3SY56 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SP6Q3SY56 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SP6Q3SY56 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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SP6Q3SY56 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SP6Q3SY56 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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