Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 GGT3P-204ENST00000453783 1664 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCDC57Q2TAC2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CCDC57Q2TAC2 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms